Durante los siguientes años, Peczley observó el iris a centenares de personas, lo que le permitió ir elaborando los primeros gráficos de situación y su correspondencia en las enfermedades o lesiones corporales. Esta labor de paciente investigación fue facilitada de forma notable durante el período que pasó en prisión, acusado de prácticas revolucionarias. Al ser liberado siguió sus estudios de medicina y pasó a ser interno en las salas del hospital de la facultad, donde tuvo oportunidad de ir constatando sus teorías, comprobando las marcas que dejaba la enfermedad antes y después de ser curada. Lo acertado de sus diagnósticos, que algunos tachan de "milagrosos", hace que su fama se extienda por todo el país. Hace públicos sus diagramas del ojo y sienta los conceptos de lo que sería una nueva ciencia, la IRIDODIAGNOSIS. Su definición : "IRIDOLOGIA, es la ciencia que revela los desórdenes funcionales del cuerpo humano por alteraciones del tejido iridial, círculos concéntricos, oscurecimiento, nubecillas y decoloraciones del iris del ojo". Para Peczely el iris - pupila hace las funciones de un fiel radar, que detecta las enfermedades y las "anota" mediante filamentos nerviosos, fibras musculares y minúsculos vasos sanguíneos en forma de signos, marcas y coloraciones. El primer discípulo de Peczely fue el doctor Schlegel, que publicó dos obras sobre el diagnóstico de las enfermedades por el iris. Más tarde, el sacerdote sueco Liljequist, interesado en el nuevo arte del diagnóstico, descubre que existe una relación entre la decoloración amarillenta de sus ojos y el crónico envenenamiento por la quinina, que ha tomado como consecuencia de haber sufrido malaria. Esta circunstancia le induce a estudiar otras pigmentaciones colorantes producidas por la ingestión de drogas. Sus nuevos descubrimientos le impulsan a rehacer los primitivos gráficos de Peczely, describiéndose por vez primera los signos, marcas y colores que indicaban el envenenamiento por medicamentos. Estos registros comprende que son producidos a causa de los residuos de los medicamentos, ya que tras su ingestión no son expulsados al exterior en su totalidad por los riñones, intestinos, pulmones, piel, etc., reflejándose en el iris sustancias extrañas a los tejidos que conforman el organismo, enrareciendo la sangre y dificultando los procesos vitales.
